序：表層水との違い
清浄性 ： 人間の排水で汚染された河川水の影響を受けないため、化学物質による汚染がない。また、太陽光が届かないためプランクトン等が成育しないので、有害な雑菌等も表層水の千分の一以下と少ないことが特徴である。このため、深層水は表層水に比べて細菌学的にも化学的にもはるかに清浄である。
無機栄養塩類が豊富 ： 表層水に比べて、植物プランクトンの成長に必要な無機栄養塩類（NO3-ショウ酸態窒素、PO4-リン酸態リン、Si ケイ素）が豊富である。これは海洋深層水中の植物プランクトンが少ないために、表層から沈降してくる魚類の死骸が分解されて生じた無機栄養塩類が消費されずに残っているためである。
低温安定性 ： 水温をはじめ含まれる成分が年間を通して一定であり、水質が安定しているという特徴がある。